1、综合科：协助局领导处理机关日常事务；负责机关文电、保密、信访、档案管理、接待、安全保卫、后勤服务等工作；负责审计宣传、审计信息等工作；组织有关重要会议；起草和审核有关文件、报告及管理制度；编制局工作计划；管理审计经费、公费医疗审核和固定资产；负责审计统计；负责审计业务综合考核；负责局计算机辅助审计系统、审计管理系统、办公自动化系统的规划与管理；负责计算机审计软件的开发与运用，以及局计算机使用管理方面的其他工作。（人员配置：周恩情、王正栋、鲁月霞。电话：83230137。）
        2、固定资产投资审计科：负责管理、协调、监督区国家建设项目的审计业务；负责对区基本建设项目进行开工前审计和竣工决算审计；负责审计政府国债等建设项目的财务收支；负责审计基本建设单位的财务收支和投资效益；负责专项建设资金的审计和审计调查；负责审计区级政府管理的水利、国土资源、环保资金的筹集、管理和使用情况；开展专项审计和审计调查；负责对区属工业、商贸、物资、房地产开发等国有企业的财政财务收支和资产、负债及损益情况进行审计；负责对中外合资、合作企业、境外企业的资产、负债和损益进行审计；对区国有资产经营公司、区政府授权经营国有资产的公司或单位进行审计监督；组织专项审计和审计调查。（人员配置：王海峰、刘宏达、黄司晨、钱俊生。电话：83230159。）
        3、行政事业审计科：拟定区级财政预算执行情况的审计工作方案，汇总审计结果；负责审计区财政局组织预算执行和其他财政收支、区金库办理预算资金的收纳拨付情况；负责开展财政专项资金审计及专题审计调查；负责审计与区财政有拨缴款关系的区人大机关、区政协机关、区司法机关、区党政机关和民主党派机关、社会团体的财政财务收支；负责审计区政府有关部门的财政财务收支；组织行政事业与社会保障专项审计和审计调查。（人员配置：毛文波、花伟星。电话：83230156。）
        4、经济责任审计科：负责并协调区管党政领导干部、企业领导人员任期经济责任审计工作；负责并协调有关经济案件的审计工作；汇总全区经济责任审计情况；对全区内部审计工作进行指导和监督；参与制定审计、财经方面的规定、办法、制度和其他规范性文件；负责收集整理财经法规，组织实施审计普法教育；负责审计复核、审计听证和行政诉讼应诉等工作；检查审计执法情况，监督社会审计组织的审计业务质量。（人员配置：顾宜生、赵振洪、陆宗泽。电话：83230136。）